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Stressantworten und p53-vermittelte Apoptose nach Chemotherapie

Diese Arbeit hatte zum Ziel p53-abhängige Veränderungen der Zellvitalität nach DNA-schädigender Chemotherapie zu untersuchen. Zwei Genotypen, p53wt und p53-/-, der humanen Darmkrebszelllinie HCT116 wurden mit Irinotecan (CPT-11) und Entinostat (MS-275) für bis zu 48 h behandelt. CPT-11 löste DNA-Schäden…

Structure determination of peptide-heme complexes

Heme has been traditionally viewed as a stable protein cofactor in hemoproteins. Only recently it is also being viewed as a signaling and regulatory molecule that binds temporarily to proteins and regulates their activation or inhibition. Information on the structural characteristics of heme regulatory…

Modulation of the replication stress response by histone deacetylases is connected to suppression of the PP2A regulatory…

The integrity of the genome is constantly challenged by genotoxic factors and also DNA duplication during every cell cycle. Resolving replication stress and DNA lesions critically involves the kinases ATR and ATM as part of the DNA damage response (DDR). Until now, several clinical studies revealed…

Regulation of immunoglobulin diversification by checkpoint signalling

The primary immunoglobulin (Ig) repertoire is further diversified during secondary Ig diversification in germinal centre B cells. The secondary Ig diversification via somatic hypermutation and class switch recombination in humans and mice or by Ig gene conversion in some farm animals like chickens is…

Klonierung und in vivo Analyse von Proteinen des menschlichen inneren Kinetochors

Die korrekte Trennung der Schwesterchromatiden während der Mitose ist unumgänglich für die Stabilität des Genoms und somit ein Grundpfeiler des Lebens. Um diese Herausforderung zu bewältigen, besitzt jedes Chromosom an der primären Einschnürungsstelle einen Proteinkomplex, das Kinetochor, welches die…

Evidence for multiple functions of Aprataxin in DNA damage repair

This dissertation addresses the structural and functional characterization of human Aprataxin, a DNA damage repair protein with a unique activity not found for any other protein involved in DNA repair. Single strand breaks (SSBs) threaten genomic stability, as more than 10.000 of such SSBs arise per…

Identifizierung und funktionelle Charakterisierung von putativen Seneszenzgenen auf Chromosom 4q und 10p in Bezug auf das…

Prädisponierend für die Entstehung eines Zervixkarzinoms ist die persistierende Infektion mit humanen Papillomaviren (HPV), insbesondere den Hochrisiko-Typen (HR) 16 und 18. Von 100 infizierten Frauen entwickeln circa 1 - 2 Frauen ein Zervixkarzinom. Dieses geht in der Regel aus einer prämalignen Neoplasie…

Small hairpin RNA-vermittelte Inhibierung der Genexpression von Phosphoinositid 3-Kinasen in humanen Neuroblastomzellen

Das Neuroblastom ist ein sympathikoadrenaler Tumor der Neuralleiste und tritt vorrangig im Neugeborenen- und Kindesalter auf. Eine besonders schlechte Prognose des Krankheitsverlaufs ist mit einer Amplifikation des Tumorsuppressorgens MYCN assoziiert. Durch Verwendung von Inhibitoren gegen die Phosphoinositid…

Die Rolle der PML-Kernkörperchen bei der Regulation der MHC Klasse II-Expression

Die Regulation der Lokalisation von Genen im Zellkern ist ein wichtiges Transkriptions-Kontrollelement in Eukaryoten. Für Wirbeltierzellen konnte gezeigt werden, dass bestimmte Gene mit Kernkörperchen assoziieren, wodurch möglicherweise deren Transkriptionsaktivität moduliert wird. Promyelozytische Leukämie…

DNA-Doppelstrangbruchreparatur-Dysfunktion bei Brustkrebs : Etablierung und Evaluierung eines funktionellen Test als Biomarker…

Das Mammakarzinom stellt weltweit die häufigste Krebserkrankung bei Frauen dar und ist unter anderem auf genetische Prädisposition zurückzuführen. In diesem Zusammenhang konnten bisher Brustkrebs-relevante Keimbahnmutationen in zehn Genen detektiert werden, deren Genprodukte direkt oder indirekt in die…

Biochemische und funktionelle Charakterisierung der Interaktion des Tumorsuppressorproteins p53 und der Peptidyl-prolyl cis/trans…

The tumor suppressor p53 acts as a stress activated transcription factor that directs the expression of genes involved in growth control. A number of signaling pathways are controlled by p53, including DNA damage response, cell cycle control and induction of apoptosis. The p53 protein is tetrameric and…

The role of the neck linker and neck in kinesin velocity regulation

Kinesins are microtubule-associated motor proteins that convert the chemical energy of ATP into mechanical energy to perform a wide range of intracellular motility functions. Kinesin molecules represent long-stretched structures revealing distinct globular motor domains, composed of a conserved catalytic…

Charakterisierung des Transkriptionsfaktors CcpN aus Bacillus subtilis

Katabolitrepression, die Fähigkeit, nicht benötigte alternative Stoffwechselwege beim Vorhandensein einer bevorzugten Nahrungsquelle abzuschalten, ist eine wichtige Eigenschaft zahlreicher Bakterien. In Bacillus subtilis wird diese Aufgabe unter anderem vom Transkriptionsfaktor CcpN übernommen, welcher…

Identification and characterization of Eya1-interacting proteins

Mutations in the human EYA1 gene are associated with several congenital disorders, as for example BOR (branchio-oto-renal) syndrome. BOR patients suffer from severe malformations of the ear, the branchial arches and the kidneys. The mechanisms by which EYA1 mutations cause human disease are only poorly…

Physikalischer Status des HPV16 Genoms und die virale Onkogenexpression : Bedeutung für die Zervixkarzinogenese

Die Kausalität zwischen einer Infektion mit Humanen Hoch-Risiko Papillomaviren (HR-HPV) und dem Zervixkarzinom (CxCa) ist erwiesen. Das CxCa entsteht aus zervikalen Neoplasien (CIN). Bekannt ist eine häufigere Integration des viralen Genoms in CxCa im Vergleich zu CIN. Aufgrund des E2-Repressor Verlustes…

Untersuchungen zur Regulation des humanen Replikationsfaktors Cdc45

Zur Wahrung der genomischen Integrität einer Zelle muss sichergestellt werden, dass das komplette Genom einmal und nur einmal in jedem Zellzyklus dupliziert wird. In der M-/G1- hase wird an den Startpunkten der Replikation durch sukzessive Bindung der Replikationsproteine Cdc6, Cdt1 und Mcm2-7 der sogenannte…

In vitro-Charakterisierung regulatorischer und sensorischer RNAs in Prokaryoten

Im Rahmen dieser Arbeit wurden eine cis-kodierte und eine trans-kodierte Antisense-RNA aus Bacillus subtilis sowie eine RNA-Thermometerstruktur aus Salmonella enterica in vitro strukturell und funktionell charakterisiert. In vitro-Analysen zur inhibitorischen Wirkung der cis-kodierten Antisense-RNA RNAIII…

Humane Topoisomerase I und genotoxischer Stress

Nach Behandlung von Kulturzellen mit geno- oder zytotoxischen Agenzien kann die Bildung stabilisierter kovalenter Komplexe zwischen der humanen Topoisomerase I (hTopoI) und der DNA detektiert werden. Die Ausprägung dieser als hTopoI-Schadensantwort bezeichneten zellulären Reaktion widerspiegelt offenbar…

Towards the architecture of the human inner kinetochore

Im Rahmen der Dissertation „Towards the architecture of the human inner kinetochore“ wurden Proteininteraktionen im humanen inneren Kinetochor untersucht. Dazu wurden die fluoreszenzmarkierten Kinetochorproteine CENP-A, CENP-B, CENP-C, CENP-I und Histone H1, H2A, H3 und H4 mittels AB-FRET (acceptor bleaching-fluorescence…

Der humane Replikationsfaktor Cdc45 : Lokalisation und Interaktionspartner

Cdc45 (cell division cycle protein 45) ist ein essentieller Replikationsfaktor, der in der Initiation und Elongation der DNA-Replikation beteiligt ist. Ziel dieser Arbeit war es, die Lokalisation und mögliche Interaktionspartner von humanem Cdc45 mittels biochemischer und zellbiologischer Techniken zu…