Satellitome Analysis in the Southern Lapwing ( Vanellus chilensis ) Genome : Implications for SatDNA Evolution in Charadriiform Birds

Affiliation
Departamento de Ecologia, Zoologia e Genética, Universidade Federal de Pelotas, Pelotas 96010-900, RS, Brazil;
Kretschmer, Rafael;
ORCID
0000-0002-8084-1787
Affiliation
Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos 13565-905, SP, Brazil;(G.A.T.);(G.A.D.);(M.d.B.C.)
Toma, Gustavo A.;
Affiliation
Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos 13565-905, SP, Brazil;(G.A.T.);(G.A.D.);(M.d.B.C.)
Deon, Geize Aparecida;
ORCID
0000-0002-2061-9690
Affiliation
Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil;(N.d.S.);(R.Z.d.S.);(R.U.);(F.P.-F.)
dos Santos, Natalia;
Affiliation
Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil;(N.d.S.);(R.Z.d.S.);(R.U.);(F.P.-F.)
dos Santos, Rodrigo Zeni;
Affiliation
Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil;(N.d.S.);(R.Z.d.S.);(R.U.);(F.P.-F.)
Utsunomia, Ricardo;
Affiliation
Faculdade de Ciências, Universidade Estadual Paulista, Bauru 13506-900, SP, Brazil;(N.d.S.);(R.Z.d.S.);(R.U.);(F.P.-F.)
Porto-Foresti, Fabio;
ORCID
0000-0002-7315-0590
Affiliation
Laboratório de Diversidade Genética Animal, Universidade Federal do Pampa, São Gabriel 97300-162, RS, Brazil;(R.J.G.);(A.D.V.G.)
Gunski, Ricardo José;
Affiliation
Laboratório de Diversidade Genética Animal, Universidade Federal do Pampa, São Gabriel 97300-162, RS, Brazil;(R.J.G.);(A.D.V.G.)
Garnero, Analía Del Valle;
GND
115661239
ORCID
0000-0003-1672-3054
Affiliation
Institute of Human Genetics, Friedrich Schiller University, University Hospital Jena
Liehr, Thomas;
ORCID
0000-0001-6315-3352
Affiliation
Laboratório de Citogenô mica e Mutagênese Ambiental, Seção de Meio Ambiente, Instituto Evandro Chagas, Ananindeua 67030-000, PA, Brazil;
de Oliveira, Edivaldo Herculano Corra;
Affiliation
Laboratório de Citogenética e Evolução, Departamento de Genética, Instituto de Biociências, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre 91509-900, RS, Brazil;
de Freitas, Thales Renato Ochotorena;
ORCID
0000-0003-4340-1464
Affiliation
Departamento de Genética e Evolução, Universidade Federal de São Carlos, São Carlos 13565-905, SP, Brazil;(G.A.T.);(G.A.D.);(M.d.B.C.)
Cioffi, Marcelo de Bello

Vanellus (Charadriidae; Charadriiformes) comprises around 20 species commonly referred to as lapwings. In this study, by integrating cytogenetic and genomic approaches, we assessed the satellite DNA (satDNA) composition of one typical species, Vanellus chilensis , with a highly conserved karyotype. We additionally underlined its role in the evolution, structure, and differentiation process of the present ZW sex chromosome system. Seven distinct satellite DNA families were identified within its genome, accumulating on the centromeres, microchromosomes, and the W chromosome. However, these identified satellite DNA families were not found in two other Charadriiformes members, namely Jacana jacana and Calidris canutus . The hybridization of microsatellite sequences revealed the presence of a few repetitive sequences in V. chilensis , with only two out of sixteen displaying positive hybridization signals. Overall, our results contribute to understanding the genomic organization and satDNA evolution in Charadriiform birds.

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