Charakterisierung genetischer und epigenetischer Veränderungen von Medulloblastomzellen mittels MLPA-Analyse

Feierabend, Denise

Sowohl Amplifikationen von Onkogenen als auch Deletionen oder Promotorhypermethylierungen von Tumorsuppressorgenen spielen eine entscheidende Rolle in der Karzinogenese. Die MLPA (multiplex ligation-dependent probe amplification) stellt ein Analyseverfahren dar, welches die Detektion von Kopienzahländerungen im Multiplex-Ansatz ermöglicht. Durch eine Erweiterung der Methodik, die MS-MLPA (methylation-specific-MLPA), können darüber hinaus Promotormethylierungen von TSGs erfasst werden. In der vorliegenden Arbeit wurden genetische Aberrationen von Medulloblastomzellen mithilfe dieser Verfahren analysiert. Hierfür standen insgesamt 25 Medulloblastomproben 8 Paraffin-gebettete Proben, 12 kryokonservierte Exemplare sowie 5 DNA-Aufarbeitungen aus Medulloblastom-Zellkulturlinien) zur Verfügung. Unter Verwendung dreier Probenkits (Fa. MRC Holland) konnten 77 verschiedene Gene auf ihren Kopienzahlstatus sowie 33 Tumorsuppressorgene auf Promotorhypermethylierungen untersucht werden. Die Analyse des Kopienzahl- und Methylierungsstatus der Medulloblastomproben konnte 256 Amplifikationen, 237 Deletionen sowie 122 Genmethylierungen herausstellen. Der Vergleich der einzelnen Probengruppen erbrachte signifikante Unterschiede des Aberrationsverhaltens von Primärtumoren zu humanen Medulloblastomzelllinien. Die Beleuchtung häufig involvierter Gene bestätigte bereits bekannte Aberrationen. Gleichzeitig wurden neue, interessante Mutationen erhoben. Die Korrelation der Analyseergebnisse mit klinischen Daten konnte statistisch relevante Zusammenhänge aufzeigen. Ein Vergleich der verschiedenen Probenmaterialien bzw. deren Fixierungsmethoden offenbarte Unterschiede in der Aussagekraft für genetische und epigenetische Untersuchungen. Die Erfassung genetischer und epigenetischer Veränderungen von Medulloblastomen, für die die vorliegende Arbeit neue Ansatzpunkte aufzeigen konnte, sollte Gegenstand weiterer Forschungsarbeiten sein

Zitieren

Zitierform:

Feierabend, Denise: Charakterisierung genetischer und epigenetischer Veränderungen von Medulloblastomzellen mittels MLPA-Analyse. 2014.

Zugriffsstatistik

Gesamt:
Volltextzugriffe:
Metadatenansicht:
12 Monate:
Volltextzugriffe:
Metadatenansicht:

Grafik öffnen

Export